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MiniAmp and MiniAmp Plus Thermal CyclerINSTALLATION, USE, AND MAINTENANCEfor use with Invitrogen and Applied Biosystems PCR reagentsCatalog Numbers A27834, A27835Publication Number MAN0017492Revision A.0For Research Use Only. Not for use in diagnostic procedures.
Manufacturer: Life Technologies Holdings Pte Ltd Block 33 Marsiling Industrial Estate Road 3 #07-06, Singapore 739256The information in this guide is subject to change without notice.DISCLAIMER: TO THE EXTENT ALLOWED BY LAW, LIFE TECHNOLOGIES AND/OR ITS AFFILIATE(S) WILL NOT BE LIABLE FOR SPECIAL, INCIDENTAL,INDIRECT, PUNITIVE, MULTIPLE, OR CONSEQUENTIAL DAMAGES IN CONNECTION WITH OR ARISING FROM THIS DOCUMENT, INCLUDING YOURUSE OF IT.Important Licensing Information: These products may be covered by one or more Limited Use Label Licenses. By use of these products, you acceptthe terms and conditions of all applicable Limited Use Label Licenses.TRADEMARKS: All trademarks are the property of Thermo Fisher Scientific and its subsidiaries unless otherwise specified. 2018 Thermo Fisher Scientific Inc. All rights reserved.
Contents Product information . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 6Product description . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 6Instrument overview . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 6 Start, sign on, and configure the instrument . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 7Required materials not provided . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 7 Set up the MiniAmp or MiniAmp Plus Thermal Cycler . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 7Touchscreen controls . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 9Home screen controls . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 9Enter text . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 10Enter numbers . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 10 Connect the instrument for remote monitoring (Optional) . . . . . . . . . . . 11Set up the wired connection . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 11Set up the wireless connection . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 14Create a user profile on the PCR instrument . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 15Create a Thermo Fisher Connect account . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 15Link the PCR instrument to Thermo Fisher Connect (administrator only) . . . . . . . . . . . . . . 15Add a PCR instrument to your Thermo Fisher Connect account . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 16 Methods . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 17Create/Edit Method . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .Create a new Method . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .Create a custom method . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .Edit a Method . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .Manage protocols and Advanced options . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .Manage Methods and Folders . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .171718192125Open and run Method . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .Load samples into the instrument . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .Perform a run . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .Monitoring a run . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .View and export the run report . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .Remove the samples from the instrument . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .292929323434MiniAmp and MiniAmp Plus Thermal Cycler User Guide3
Contents Maintenance . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 35Clean the instrument . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .Preparation . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .Clean the touchscreen . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .Clean the sample wells . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .Decontaminate the sample wells . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .Clean the heated cover . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .Decontaminate the heated cover . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .35353535363636Replace the fuses . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 37Required materials . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 37Procedure . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 37Upgrade the system firmware . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .Determine firmware version on instrument . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .Download new firmware . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .To upgrade the instrument with the new firmware: . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .37373738Self Verification test . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 39Procedure . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 39 APPENDIX A Troubleshooting . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 40Troubleshooting . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 40Return an instrument for service . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 41 APPENDIX B Set up mobile connectivity on a mobile device . . . . . . . . 42Set up mobile connectivity on a mobile device . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 42 APPENDIX C Recommended instrument settings . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 43Recommended instrument settings . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .Instrument settings . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .Restore Factory Settings (Administrator profile only) . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .About Instrument . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .Run history . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .Maintenance and services . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .USB shortcuts . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .Manage users (Administrator profile only) . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 4343464747484949APPENDIX D Parts and materials . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 51Instrument part numbers . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 51Consumables . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 514MiniAmp and MiniAmp Plus Thermal Cycler User Guide
Contents APPENDIX E Instrument specification and layout . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 53Site requirements . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 53Environmental requirements . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .Temperature and humidity requirements . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .Pollution . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .Altitude . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .53535353Technical specifications . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 54System specifications . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 55Power and communication port symbols . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 55Location of power point and ports on the instrument . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 56 APPENDIX F Predefined run methods . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 57 APPENDIX G Safety . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 74Symbols on the instrument . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 74Safety alerts on this instrument . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 76Location of safety labels on the instrument . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 77China RoHS Compliance . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 78Safety information for instruments not manufactured by Thermo Fisher Scientific . . . . . 79Instrument safety . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .General . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .Physical injury . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .Electrical . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .Cleaning and decontamination . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .7979797980Safety and electromagnetic compatibility (EMC) standards . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .Safety . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .EMC . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .Environmental design . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .80808181Chemical safety . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 82Biological hazard safety . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 83 APPENDIX H Documentation and support . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 84Placeholder for related documentation . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 84Customer and technical support . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 84Limited product warranty . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 84MiniAmp and MiniAmp Plus Thermal Cycler User Guide5
Product informationProduct descriptionThe MiniAmp Thermal Cycler and the MiniAmp Plus Thermal Cycler are endpoint thermal cyclers, specifically designed for the amplification of nucleic acids usingthe Polymerase Chain Reaction (PCR) process. The user interface includes atouchscreen with a graphical display that shows the time, status, and temperature foreach run. A touchscreen keypad allows you to enter information into fields on thedispla
ยท Uninterruptible power supply (1.5-kVA) Set up the MiniAmp or MiniAmp Plus Thermal Cycler IMPORTANT! Save the packing materials and box in case you need to ship the instrument in for service. 1. Open the shipping crate to unpack the instrument. You should receive one box containing the thermal cycler and the accessories. 2. Remove the packing material, then inspect the instrument for .
